Falls es das nicht ist, wäre noch eine Idee, dass du die Buchsen vertauscht hast und dein Rad daher nicht in der korrekten Position laufen und die Scheibe deshalb seitlich gegen die Bremsbeläge schiebt. Im Werkstatthandbuch der 1000er waren die Buchsen genau vertauscht dargestellt, bei der 1100er weiß ich's nicht.
Ansonsten fürs nächste mal: du musst den Bremssattel gar nicht an der Stelle entfernen. Der Halter, an den der Bremssattel dort angeschraubt ist, wird durch eine Nut an der Schwinge geführt und durch die Achse selbst in Position gehalten und verspannt. Einfach die Achse ziehen und man kann das Hinterrad nach hinten raus ziehen, der Bremssattel bleibt an Ort und Stelle